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买麻藤类植物全基因组破译

麻类

  近日,深圳市中科院仙湖植物园副研究员万涛团队与中科院中非联合研究中心、兰科中心、诺禾致源(Novogene)、英国皇家植物园邱园、中科院植物研究所、武汉大学等院所合作开展的“买麻藤全基因组计划”取得重大进展。相关研究1月29日以封面长文形式在线发表于《自然植物》杂志。

  裸子植物和被子植物的起源、分歧及演化,是现代植物学科的基础热点领域。买麻藤类植物因独有的形态特征以及历史研究背景,被喻为“百年之谜”。

  研究人员通过开发新的基因组组装软件,克服了裸子植物高重复和高杂合的技术难点,对接近4.5G的买麻藤进行全基因组测序组装,并结合转录组数据,对现今已发表的17种代表性陆地植物进行了全基因组比较及相关分析。首次揭示了早期种子植物不同分支的基因组演化历史并推导了其共同最近祖先的古老基因组特征。研究发现,买麻藤的基因组特征显著区别于其他已报道的种子植物(针叶树、银杏、被子植物),在某些特定的特征上如内含子、重复序列进化模式和现存最古老被子植物无油樟“相似”。

  此外,买麻藤在种子植物保守功能基因集合(现存种子植物共享)呈现出非常古老的状态,暗示并未发生剧烈的家族扩张和收缩。文章从基因组层面,全面分析并呈现了买麻藤独有的“特质”,帮助我们对种子植物共同祖先的特定基因组特征进行了推演和讨论,同时也为目前作为针叶树姐妹群的假说提供了新的思考,暗示了种子植物早期的演化比我们想象中更为复杂。

  美国植物进化研究专家Michael S. Barker认为,该成果为研究早期种子植物的分歧演化提供了极为重要关键的数据资源,论文的分析将对人类重新理解种子植物演化及适应历史提供新的视角。

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本站文章于2019-11-28 05:12,互联网采集,如有侵权请发邮件联系我们,我们在第一时间删除。 转载请注明:买麻藤类植物全基因组破译 麻类